Si, por lo que sea (en mi caso, mi entorno de pruebas), necesitas eliminar la sincronización entre tu Active Directory y Azure Active Directory hoy te dejo los pasos de cómo hacerlo.
Desactiva la sincronización primero
Antes de desinstalar Azure AD Connect, lo primero que necesitas es desactivar la sincronización. Para ello debes lanzar los siguientes comandos a través de PowerShell:
#Install MSOnline Module
Install-Module -Name MSonline
#Get credential as a Azure AD Global Admin
$msolcred = Get-Credential
#Connect to Azure AD
Connect-MsolService -Credential $msolcred
#Check Synchronization status
(Get-MSOLCompanyInformation).DirectorySynchronizationEnabled
#Disable Sync
Set-MsolDirSyncEnabled –EnableDirSync $false
#Check Synchronization status again
(Get-MSOLCompanyInformation).DirectorySynchronizationEnabled
Este proceso no es inmediato y puede tardar hasta 72 horas en completarse, dependiendo del tamaño de tu directorio.
Desinstala Azure AD Connect
Una vez que tienes la sincronización desactivada ya puedes eliminar Azure AD del dominio.

¡Saludos!